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[求助] 代谢组学1H谱相位和数据处理

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发表于 2010-10-8 11:46:43 | 显示全部楼层 |阅读模式

 

- p7 J8 h8 H4 F

 

& b' Q; u3 I4 O1 n

  请大家帮帮忙啊!

% d# j4 z. T1 J% O$ l* L5 H

 

- a( C* @- F! j

我的有些1H谱分段积分后出现很多负值,有峰的位置为负值无峰的却为正值,是相位的原因吗?应该怎么调整啊?相位好的标准是什么啊?

8 |6 H4 G. p% h( Y' B4 i

 

; d1 M+ i1 d, s' f6 n- I0 ~ W

另外,1H谱分段积分后有正值和负值,做PCA分析时怎么办啊,负值改为0吗?

) {- ^5 o: Z1 }9 P

 

$ f: J/ o# j& P+ n8 d) i

用MestRe-C处理的,放在了word里。

7 ^- Q: y1 E( i+ Y

 


$ n% j6 M' M: z
[此贴子已经被作者于2010-10-8 16:30:38编辑过]
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发表于 2010-10-8 14:57:47 | 显示全部楼层
图谱贴上来看看。
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 楼主| 发表于 2010-10-9 14:50:12 | 显示全部楼层

 

# \) [3 b: P+ b: n+ Z. j( {

 

' F1 c: Z% ~" h) T! h2 s

     谢谢啦!那相位调节到什么程度是好呢?基线调整中用多点基线校正(两个点,线性)可以吗?

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发表于 2010-10-11 00:12:06 | 显示全部楼层
baseline correction 若能使用cubic spline , 点数可用70 to 100 点来平均.
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 楼主| 发表于 2010-10-11 21:50:46 | 显示全部楼层

 

6 M9 m ^% C8 T' n# J x

 

) O6 L" O* V: P, `- ]- ? Z

  我这方面懂得太少了,MestReC里面没有找到,能给详细介绍下吗?谢谢啦! 我的qq:416389286

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发表于 2010-10-11 23:45:04 | 显示全部楼层
cubic spline 是在topspin之baseline correction 中见到, MestRe-C不知有无?
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 楼主| 发表于 2010-10-14 16:40:24 | 显示全部楼层
MestRe-C好像没有,
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 楼主| 发表于 2010-10-14 16:41:23 | 显示全部楼层
MestRe-C好像没有,还有其他办法吗?
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发表于 2010-10-16 17:49:41 | 显示全部楼层
可以将si改大成 256K,512K或1000K, 再ft, 记得用手动调phase,& ~' J' a! ^! g* f# ]' N 将峰在垂直及水平方向尽量放大,调整相位之0th及1st order , 相位需调到左右二边一样高,然后再做基线调整(baseline correction).1 w' M0 I2 v2 y& @, x
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 楼主| 发表于 2010-10-18 20:53:08 | 显示全部楼层
  太感谢了,试了几个效果很好!
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