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[求助]请问15N标记蛋白做三维实验前应做哪些实验准备,万分感谢

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发表于 2010-5-26 10:29:23 | 显示全部楼层 |阅读模式

本人以前是做多肽结构的,现有一90残基的15N标记蛋白想测结构,有些问题想请教做过的各位大师,请好心人指点,谢谢!

3 V1 W& _( L$ Z. ^8 e9 n

 

) A' P5 h: t' A; _4 a. P: z

问题1:前期准备工作应做哪些?我现在知道的有以下几个,不知是否必要,

& w$ u8 c6 Q, G: b4 C

1. 蛋白样品的1H90度(是否需要用zgpr压水)

0 t1 r* V. F* g8 n) K+ ?, u

2.15N的90度

$ V2 r. O' c ]8 Z1 o+ {! C! t

3.1H-15N HSQC(是否必须?)

* J# O; k, ^( k: _3 {

 

* v! k- B! t/ v% Z2 M! s

问题2:只是15N标记,要测的三维实验有哪些,我知道的有:15N-TOCSY,15N-NOESY,不知是否还需测HNHA,HNHB,我用CYANA算结构

+ B& r2 z2 Q5 `3 t6 g6 s

 

5 F! ]0 S2 m7 r) r

问题3:我的样品浓度能到1.5mM,不知ns设多少合适,一个三维实验大概需要多长时间?

, @. I$ a; @" y( |" N

 

4 G5 v' A# q9 _

 

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发表于 2010-5-26 21:40:43 | 显示全部楼层

想做什么样的三维实验?90个残基,一般来说只用N15标记可能不够了,需要C13的标记,先解骨架的序列。

: S0 x2 Q( I7 B. e

一般先做正常的二维HSQC,做buffer的筛选,得到一张分辨率足够好的图,每个信号都清楚,如果到1.5mM一般估计一次HSQC做4-8 Scan就够了,浓度差不多了。

1 i* Y9 n# i9 i' t6 |2 k

 

6 D2 y% Y) v* f# c, h

压水是肯定的了

2 f' M7 B K. w

 

# A- _: s$ g1 U3 f- s% v

你如果还没有筛选到buffer,就不要先做后面的了,没用

0 G4 O9 Y8 V' ^" W
[此贴子已经被作者于2010-5-26 21:41:43编辑过]
! o* I, j6 i# a
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