[求助]菜鸟提问，mestrenova能直接得到J耦合常数吗？

lvgh · 发表于 2008-12-19 23:06:30

因为实验需要，需要解析一个小肽的nmr结构，第一步的氨基酸顺序识别已经完成，现在需要计算得到耦合常数和NOE。弱弱的问一下，mestrenova能直接得到J耦合常数和NOE 吗？如何得到啊？tutorial中有说明吗？另外，还想向高手咨询下，如何利用Karplus方程计算得到二面角呢？mestrenova能处理出来吗？

提的问题可能比较幼稚，还请高手们帮忙指教,先行谢过了：）

[此贴子已经被作者于2008-12-19 23:08:05编辑过]

windtodie · 发表于 2008-12-20 01:52:26

耦合常熟可以直接得到，其他的不清楚

lvgh · 发表于 2008-12-20 14:45:09

非常感谢windtodie的回复！

怎么得到耦合常数啊?哪个菜单下有这个功能啊？

再次感谢windtodie善意的解答：）

frankhuang · 发表于 2008-12-21 02:13:56

mestrenova可以自动计算藕合常数，先选定带J的工具图标下拉三角，选择manual，点拉选定你要计算的峰，这时候被选的峰就会出现一个方框，方框里标有字母A，用来标示你选择的峰，然后点拉下一个峰，标示为B，依次选择完你要计算的所有峰，然后点击“VIEW”栏-“Tables’，将出现一个类似Excel的表格，将表格拉大，可以看到有很多项关于积分，位移，耦合常数的信息，还可将这些信息复制到Excel中，很方便的。

frankhuang · 发表于 2008-12-21 02:23:49

NOE可以计算得到？不明白！

我理解NOE应该是类似于H-HCOSY是二维谱吧，只是这些相关氢是在空间上接近而已。

我瞎说了一通，也许我还没有理解楼主的问题吧，希望能帮到楼主，如果这些信息对楼主没有帮助就只当是水帖好了，哈哈！

windtodie · 发表于 2008-12-21 07:00:22

franhuang 回答的很详细，标完耦合常熟后，在耦合常熟图标里，也可以选 report(报告），或copy(拷贝，得到整个普图的报告。only know this, I cannot input chinese now, sorry

lvgh · 发表于 2008-12-22 12:05:44

非常感谢各位高手的指教：）

我现在还遇到一个小问题，按照franhuang的详细指导，并参照mannual中mutiplet的说明，进行手工计算，tables中能得到积分，位移的信息，但J耦合常数栏，只有个别峰有信息。是不是需要设置coupling constans tolerance linit, 但按照操作说明还是能得不到所有裂分峰的耦合常数。

应该还是我操作不合适，还请高手们指教：）

wilton · 发表于 2008-12-22 15:08:45

lvgh: 你用耦合那个工具就可以了，设两个点有人已经说了，有时单峰是没有耦合常数的，看你积分的选取了各设置了。

lvgh · 发表于 2008-12-22 15:48:55

另外，我查看了下mestrenova的说明书，发现crosshair似乎也可以得到J-耦合常数：）

lvgh · 发表于 2008-12-22 15:55:16

感谢 wilton的回复：）

没有耦合常数，除了是单峰的原因外，有没有可能是因为coupling constans tolerance linit的原因啊？

我看了说明书，但这部分没看太明白，尤其是J‘s Editor, 什么作用啊？

菜鸟问题，给各位高手们添麻烦了：）

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