【开贴】义务解答基于核磁的代谢组学相关问题

metaboss

1.代谢组学目前的主流研究手段是NMR和色质联用两类，国内比较知名的课题组有几家，分别位于上海、大连和武汉。有兴趣的可以参见一下科学网贾伟老师的文章《代谢组学的闲谈》，http://blog.sciencenet.cn/blog-265898-299544.html。

2.代谢组学的应用非常广泛，样本对象涵盖动特、植物、微生物甚至细胞，状态可以是固态（如动物组织）、液态（如尿样血样）甚至半固态。

3.代谢组学检测对象是分子量<1000的代谢物小分子，使用NMR能检测到包括氨基酸、单糖、二糖及部分多糖、核苷酸等，使用色质联用的方法能检测到含量更低的次生代谢产物，如植物激素和脂肪酸。通俗点来说，NMR是个网眼较大的鱼网，分辨率高，灵敏度不如色质联用，能做全局性检测，在研究目标不十分明确时能有非常好的探索功能；而色质联用的办法是个网眼很小的鱼网，只能针对特定目标进行分析，检出限可以达到pM甚至更低。

$ n: s- b: |7 }! B剩下的看大家的提问了，不知道大家关注些什么？
# T% `- i( s4 o% b5 K0 j6 ?# m
本人不算什么大牛，算是涉足代谢组学的小学生，但是也不怕献丑，欢迎有兴趣的提问，看到后一定及时回复。

+ [2 o/ r2 j5 N$ p! v+ m* F

& w4 p6 [; R  r

metaboss

唉呀，都没人回复的，好冷清

跌打丸

谢谢楼主的无私奉献。我初学代谢组，得分析一批１H-NMR谱图数据。请问有MestReNova傻瓜化的详细教程吗？包括从除去水峰区，自动调整相位和基线；以乳酸为化学位移参考峰，设此为1.33 ppm；分段积分，将积分按每张谱的总积分强度归一化，并采用中值法进行标度化后，以Excel格式将所得数据输出保存。

metaboss

跌打丸 发表于 2014-7-30 16:37
# t5 v, _. H7 Y/ M2 n谢谢楼主的无私奉献。我初学代谢组，得分析一批１H-NMR谱图数据。请问有MestReNova傻瓜化的详细教程吗？包 ...

3 L/ N! P6 Y* |" Y; Z( R& L+ U5 [我目前是使用topspin来分析的，你要的教程我没有，不好意思哈！

bfj

爱死你了，兄弟，我的问题是体液样品，各代谢产物浓度都很小，水峰抑制会使其他小信号峰更明显，但怎么操作，之前看的比较多的是presat预饱和序列，求问怎么操作啊，硬件是布鲁克400M，软件就是你的topspin2.1，可以加我qq聊，839035154

bfj

看你最近活跃啊，求帮忙，别失踪，，

sslin

代谢组学方面, 北京的军科院颜老师组, 或武汉物理所的刘老师唐老师组, 研究了多年.
! w; x) n- s7 e4 V可以和他们直接讨论交流.