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[求助] 代谢组学1H谱相位和数据处理

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发表于 2010-10-8 11:46:43 | 显示全部楼层 |阅读模式

 

/ g( b" n0 n' ]: a

 

: |" ]2 Y, O; I

  请大家帮帮忙啊!

! ~5 G& A1 r$ z! v3 V) B' A# i

 

5 b( Z S& d, I

我的有些1H谱分段积分后出现很多负值,有峰的位置为负值无峰的却为正值,是相位的原因吗?应该怎么调整啊?相位好的标准是什么啊?

1 Q6 G0 f! B8 {, S; w" }1 ]

 

+ A) V j) @; [0 u; H

另外,1H谱分段积分后有正值和负值,做PCA分析时怎么办啊,负值改为0吗?

8 n" t% G; ~5 O4 d& N

 

( A& D3 [0 l( R

用MestRe-C处理的,放在了word里。

/ ]% X! j& Q: D* a7 R8 X

 


4 x* m* `0 `8 D% E6 m8 N
[此贴子已经被作者于2010-10-8 16:30:38编辑过]
8 g$ ^) O0 y. J ]! [9 F0 a0 P$ C

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发表于 2010-10-8 14:57:47 | 显示全部楼层
图谱贴上来看看。
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 楼主| 发表于 2010-10-9 14:50:12 | 显示全部楼层

 

- |2 ?0 n/ M& N

 

1 V! x6 a7 n2 P$ c5 {! {

     谢谢啦!那相位调节到什么程度是好呢?基线调整中用多点基线校正(两个点,线性)可以吗?

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发表于 2010-10-11 00:12:06 | 显示全部楼层
baseline correction 若能使用cubic spline , 点数可用70 to 100 点来平均.
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 楼主| 发表于 2010-10-11 21:50:46 | 显示全部楼层

 

( k3 e4 I& W! E

 

) e, h& B. t! Q

  我这方面懂得太少了,MestReC里面没有找到,能给详细介绍下吗?谢谢啦! 我的qq:416389286

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发表于 2010-10-11 23:45:04 | 显示全部楼层
cubic spline 是在topspin之baseline correction 中见到, MestRe-C不知有无?
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 楼主| 发表于 2010-10-14 16:40:24 | 显示全部楼层
MestRe-C好像没有,
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 楼主| 发表于 2010-10-14 16:41:23 | 显示全部楼层
MestRe-C好像没有,还有其他办法吗?
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发表于 2010-10-16 17:49:41 | 显示全部楼层
可以将si改大成 256K,512K或1000K, 再ft, 记得用手动调phase,5 B/ s0 e3 z, m5 ~' `6 O- J 将峰在垂直及水平方向尽量放大,调整相位之0th及1st order , 相位需调到左右二边一样高,然后再做基线调整(baseline correction).8 x0 |- H4 U3 ~9 G
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 楼主| 发表于 2010-10-18 20:53:08 | 显示全部楼层
  太感谢了,试了几个效果很好!
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