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【开贴】义务解答基于核磁的代谢组学相关问题

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发表于 2013-12-11 09:30:11 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 metaboss 于 2013-12-11 12:48 编辑
8 a# o3 J8 i6 M2 Q4 H- r9 Y  I  ^0 q$ `; W2 A2 y  T! w2 h* H
1.代谢组学目前的主流研究手段是NMR和色质联用两类,国内比较知名的课题组有几家,分别位于上海、大连和武汉。有兴趣的可以参见一下科学网贾伟老师的文章《代谢组学的闲谈》,http://blog.sciencenet.cn/blog-265898-299544.html5 v5 q) K  y5 v( m/ o. G

) Q5 \8 J$ P; p) I2.代谢组学的应用非常广泛,样本对象涵盖动特、植物、微生物甚至细胞,状态可以是固态(如动物组织)、液态(如尿样血样)甚至半固态。- _; Y& V" b# C' p1 T# C& }: o

8 y) L4 }8 |9 |1 k2 o" q3.代谢组学检测对象是分子量<1000的代谢物小分子,使用NMR能检测到包括氨基酸、单糖、二糖及部分多糖、核苷酸等,使用色质联用的方法能检测到含量更低的次生代谢产物,如植物激素和脂肪酸。通俗点来说,NMR是个网眼较大的鱼网,分辨率高,灵敏度不如色质联用,能做全局性检测,在研究目标不十分明确时能有非常好的探索功能;而色质联用的办法是个网眼很小的鱼网,只能针对特定目标进行分析,检出限可以达到pM甚至更低。
/ h7 X% d9 K- G. o8 W, w
* p& a4 i2 H* Q9 O剩下的看大家的提问了,不知道大家关注些什么?
: n+ v# @! Z( o' z. C) t* y7 j* E& a5 [3 N+ l, A1 I
本人不算什么大牛,算是涉足代谢组学的小学生,但是也不怕献丑,欢迎有兴趣的提问,看到后一定及时回复。; A9 X& W8 \: ~5 q5 Q

. ]. X7 v' _) I% P$ {- q4 @9 W( q# f8 P. W4 a
* d6 I, x& O* _  Y/ p
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 楼主| 发表于 2014-1-23 10:15:54 | 显示全部楼层
唉呀,都没人回复的,好冷清
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发表于 2014-7-30 16:37:09 | 显示全部楼层
谢谢楼主的无私奉献。我初学代谢组,得分析一批1H-NMR谱图数据。请问有MestReNova傻瓜化的详细教程吗?包括从除去水峰区,自动调整相位和基线;以乳酸为化学位移参考峰,设此为1.33 ppm;分段积分,将积分按每张谱的总积分强度归一化,并采用中值法进行标度化后,以Excel格式将所得数据输出保存。
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 楼主| 发表于 2014-10-15 09:01:46 | 显示全部楼层
跌打丸 发表于 2014-7-30 16:370 G2 y) T# ~2 t( |
谢谢楼主的无私奉献。我初学代谢组,得分析一批1H-NMR谱图数据。请问有MestReNova傻瓜化的详细教程吗?包 ...

3 p$ K& L- N5 T我目前是使用topspin来分析的,你要的教程我没有,不好意思哈!
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发表于 2014-11-1 11:54:20 | 显示全部楼层
爱死你了,兄弟,我的问题是体液样品,各代谢产物浓度都很小,水峰抑制会使其他小信号峰更明显,但怎么操作,之前看的比较多的是presat预饱和序列,求问怎么操作啊,硬件是布鲁克400M,软件就是你的topspin2.1,可以加我qq聊,839035154
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发表于 2014-11-1 11:55:05 | 显示全部楼层
看你最近活跃啊,求帮忙,别失踪,,
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发表于 2014-11-13 23:32:57 | 显示全部楼层
代谢组学方面, 北京的军科院颜老师组, 或武汉物理所的刘老师唐老师组, 研究了多年.
$ y: l8 H0 |  K可以和他们直接讨论交流.
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