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Topspin2.0 的脉冲文件目录(PP)问题

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发表于 2008-10-25 18:50:53 | 显示全部楼层 |阅读模式

在一台没联谱仪的电脑上装了Topspin2.0,使用管理员登录进XP,

C:\Bruker\TOPSPIN\exp\stan\nmr\lists\pp 里放置了脉冲文件(比如说文件名ABC)

但是却在edcpul时候找不到,按照帮助文档,把XP系统的环境变量

PULPPROG_DIR=C:\Bruker\TOPSPIN\exp\stan\nmr\lists\pp 也设过了,不起作用。

新建的脉冲文件都默认存到了C:\Bruker\TOPSPIN\db\backup\PP_TABLE 文件夹下。

edpul输入后看到以下窗口,但我不知道这些脉冲文件放在哪个目录里,在C盘搜索了一下

这个窗口看到的文件名,比如De.incl ,

也没有找到,看样子是没有独立的文件.

 

这是怎么回事啊,是不是Topspin2.0版本以后都这样了。谢谢!

 

 另外,以前的版本默认的编辑器都是XP系统的notepad,2.0 topspin自己有了一个编辑器,

这个编辑器的选择设置在什么地方啊?我在user preference 里面设了

 preferred text editor为别的编辑器,但是不管用。

 


 

 

[此贴子已经被作者于2008-10-25 20:01:25编辑过]

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发表于 2008-10-26 15:39:31 | 显示全部楼层

不知道哦,varian的脉冲序列文件是必须要经过编译才能使用的

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发表于 2008-10-26 21:33:40 | 显示全部楼层
 原则上来说Bruker的pulse都保存在下面的路径

C:\Bruker\TOPSPIN\exp\stan\nmr\lists\pp

如果,你拷贝了其他的pulse到上述路径,原则上你是可以看见的,无论哪个文件是*.txt还是Bruker自己的文件格式。

你上述的描述看,你用edcpul看不到,你首先应该确认,你当前NMR文件的eda里面参数pulse program是否正确输入了你拷贝的文件的文件名,另外如果是txt文件,你的名字后面是否加了.txt

另外,你如果用edpul来查找,可以在Search里面输入*你文件名*来查找你拷贝的脉冲文件。

如果上面的都不工作(不太可能,我刚刚在topspin 2.1上测试过),你可以用最原始的方法,先把你的pulse用notepad打开,edpul打开窗口,在file里面选择new,然后给文件名,把pulse从notepad里面拷贝到此新文件,保存,你应该就可以在pulse列表里面看见了。
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 楼主| 发表于 2008-10-27 20:21:48 | 显示全部楼层
以下是引用koolmusic在2008-10-26 21:33:40的发言:
 原则上来说Bruker的pulse都保存在下面的路径

C:\Bruker\TOPSPIN\exp\stan\nmr\lists\pp

如果,你拷贝了其他的pulse到上述路径,原则上你是可以看见的,无论哪个文件是*.txt还是Bruker自己的文件格式。

你上述的描述看,你用edcpul看不到,你首先应该确认,你当前NMR文件的eda里面参数pulse program是否正确输入了你拷贝的文件的文件名,另外如果是txt文件,你的名字后面是否加了.txt

另外,你如果用edpul来查找,可以在Search里面输入*你文件名*来查找你拷贝的脉冲文件。

如果上面的都不工作(不太可能,我刚刚在topspin 2.1上测试过),你可以用最原始的方法,先把你的pulse用notepad打开,edpul打开窗口,在file里面选择new,然后给文件名,把pulse从notepad里面拷贝到此新文件,保存,你应该就可以在pulse列表里面看见了。
 
谢谢了,你最后提供的办法肯定是可以的。
我找了一下topspin1.3的help文档,看到topspin环境变量可以在topspin命令行输入设置:
env set PULPPROG_DIR=C:\Bruker\TOPSPIN\exp\stan\nmr\lists\pp
这样的话就可以,在pp里找到个人放置的pulse program了。
topsping2.0的外部编辑器指定的设置还是不行,在user preferrence里设置不能生效。

 

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发表于 2008-10-27 23:14:17 | 显示全部楼层
1.3的脉冲是单独文本保存在硬盘上的,edpul只要列出整个文件就可以。 2.0为了改进存取性能,把所有的文件集成进了HSQL数据库,搜不到单个的文件的。 如果要引入新脉冲,File > Import。 2.0中,外部编辑器设定只对edau有用,为了安全。
[此贴子已经被作者于2008-10-27 23:15:00编辑过]
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发表于 2008-10-27 23:16:31 | 显示全部楼层
C:\Bruker\TOPSPIN\db\backup\PP_TABLE 保存只是备份用的文件,你可以试试,删除这个文件后,edpul还能看到这个脉冲。
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 楼主| 发表于 2008-11-14 22:04:16 | 显示全部楼层
以下是引用yubo在2008-10-27 23:14:17的发言:
1.3的脉冲是单独文本保存在硬盘上的,edpul只要列出整个文件就可以。 2.0为了改进存取性能,把所有的文件集成进了HSQL数据库,搜不到单个的文件的。如果要引入新脉冲,File > Import。 2.0中,外部编辑器设定只对edau有用,为了安全。
[此贴子已经被作者于2008-10-27 23:15:00编辑过]

多谢你啦!

 

ps.感觉这个网站进入新页面速度有点慢。

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