【开贴】义务解答基于核磁的代谢组学相关问题

metaboss · 发表于 2013-12-11 09:30:11

本帖最后由 metaboss 于 2013-12-11 12:48 编辑

1.代谢组学目前的主流研究手段是NMR和色质联用两类，国内比较知名的课题组有几家，分别位于上海、大连和武汉。有兴趣的可以参见一下科学网贾伟老师的文章《代谢组学的闲谈》，http://blog.sciencenet.cn/blog-265898-299544.html。

2.代谢组学的应用非常广泛，样本对象涵盖动特、植物、微生物甚至细胞，状态可以是固态（如动物组织）、液态（如尿样血样）甚至半固态。

3.代谢组学检测对象是分子量<1000的代谢物小分子，使用NMR能检测到包括氨基酸、单糖、二糖及部分多糖、核苷酸等，使用色质联用的方法能检测到含量更低的次生代谢产物，如植物激素和脂肪酸。通俗点来说，NMR是个网眼较大的鱼网，分辨率高，灵敏度不如色质联用，能做全局性检测，在研究目标不十分明确时能有非常好的探索功能；而色质联用的办法是个网眼很小的鱼网，只能针对特定目标进行分析，检出限可以达到pM甚至更低。

剩下的看大家的提问了，不知道大家关注些什么？

本人不算什么大牛，算是涉足代谢组学的小学生，但是也不怕献丑，欢迎有兴趣的提问，看到后一定及时回复。

metaboss · 发表于 2014-1-23 10:15:54

唉呀，都没人回复的，好冷清

跌打丸 · 发表于 2014-7-30 16:37:09

谢谢楼主的无私奉献。我初学代谢组，得分析一批１H-NMR谱图数据。请问有MestReNova傻瓜化的详细教程吗？包括从除去水峰区，自动调整相位和基线；以乳酸为化学位移参考峰，设此为1.33 ppm；分段积分，将积分按每张谱的总积分强度归一化，并采用中值法进行标度化后，以Excel格式将所得数据输出保存。

metaboss · 发表于 2014-10-15 09:01:46

跌打丸发表于 2014-7-30 16:37
* } J( Z/ Y8 p. Y/ p, F% i6 s谢谢楼主的无私奉献。我初学代谢组，得分析一批１H-NMR谱图数据。请问有MestReNova傻瓜化的详细教程吗？包 ...

我目前是使用topspin来分析的，你要的教程我没有，不好意思哈！

bfj · 发表于 2014-11-1 11:54:20

爱死你了，兄弟，我的问题是体液样品，各代谢产物浓度都很小，水峰抑制会使其他小信号峰更明显，但怎么操作，之前看的比较多的是presat预饱和序列，求问怎么操作啊，硬件是布鲁克400M，软件就是你的topspin2.1，可以加我qq聊，839035154

bfj · 发表于 2014-11-1 11:55:05

看你最近活跃啊，求帮忙，别失踪，，

sslin · 发表于 2014-11-13 23:32:57

代谢组学方面, 北京的军科院颜老师组, 或武汉物理所的刘老师唐老师组, 研究了多年.
可以和他们直接讨论交流.

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