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[求助] 代谢组学1H谱相位和数据处理

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发表于 2010-10-8 11:46:43 | 显示全部楼层 |阅读模式

 

% r1 p5 J) d2 D+ G

 

) b# d2 N% W2 F, G" B

  请大家帮帮忙啊!

1 z- l) ]& Y- u( o" C3 S) U* E

 

6 {4 ~" v& \+ A3 p

我的有些1H谱分段积分后出现很多负值,有峰的位置为负值无峰的却为正值,是相位的原因吗?应该怎么调整啊?相位好的标准是什么啊?

0 k& J8 E$ H6 }" J- q

 

' ^- B) n; I8 |- x& J/ j0 x2 }

另外,1H谱分段积分后有正值和负值,做PCA分析时怎么办啊,负值改为0吗?

$ v# J* S$ p! s

 

1 ]( |; d4 m: w: m& v: i% `( J; f! Y

用MestRe-C处理的,放在了word里。

0 L" H& T3 z- k9 A+ P. q

 


" ?; e* l. p3 k$ A+ U9 x6 ^
[此贴子已经被作者于2010-10-8 16:30:38编辑过]
8 `3 G- i4 P) {, T% p

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发表于 2010-10-8 14:57:47 | 显示全部楼层
图谱贴上来看看。
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 楼主| 发表于 2010-10-9 14:50:12 | 显示全部楼层

 

+ {& D, l8 H' D. R4 Y

 

0 z, _& O: a+ T1 g9 v% e' _: ~

     谢谢啦!那相位调节到什么程度是好呢?基线调整中用多点基线校正(两个点,线性)可以吗?

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发表于 2010-10-11 00:12:06 | 显示全部楼层
baseline correction 若能使用cubic spline , 点数可用70 to 100 点来平均.
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 楼主| 发表于 2010-10-11 21:50:46 | 显示全部楼层

 

6 A/ m$ M) B9 P) P" l' d

 

, I4 H2 I! r4 b7 d3 [* l0 r. V

  我这方面懂得太少了,MestReC里面没有找到,能给详细介绍下吗?谢谢啦! 我的qq:416389286

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发表于 2010-10-11 23:45:04 | 显示全部楼层
cubic spline 是在topspin之baseline correction 中见到, MestRe-C不知有无?
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 楼主| 发表于 2010-10-14 16:40:24 | 显示全部楼层
MestRe-C好像没有,
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 楼主| 发表于 2010-10-14 16:41:23 | 显示全部楼层
MestRe-C好像没有,还有其他办法吗?
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发表于 2010-10-16 17:49:41 | 显示全部楼层
可以将si改大成 256K,512K或1000K, 再ft, 记得用手动调phase,& h$ m5 p! F, r8 |' o 将峰在垂直及水平方向尽量放大,调整相位之0th及1st order , 相位需调到左右二边一样高,然后再做基线调整(baseline correction).8 W5 X5 e. q8 z2 a
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 楼主| 发表于 2010-10-18 20:53:08 | 显示全部楼层
  太感谢了,试了几个效果很好!
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