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[求助]后NMR问题——CNS软件的迷惑

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发表于 2008-11-30 21:42:35 | 显示全部楼层 |阅读模式

   各位高手好,我的2D-NMR解析告一段落,现在要用CNS软件对核磁的解析结果进行计算,说实话以前没有接触过LINUX,但是我们的CNS是安装在LINUX系统中的,一些简单的LINUX命令我这几天恶补了一顿,CNS说明也看了又看,但是还是不知道该怎么对它下手,因为缺少软件操作的感性认识。

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   因此,我在这里向各位求助,希望得到一个简单而又系统的介绍,该如何使用CNS。比如,我需要写脚本吗?我的多肽序列的信息通过什么形式输入到CNS软件中?我该怎样把核磁信息比如NOE限制输入到CNS中?对CNS软件的操作都是在bash下进行命令操作吗?等等。

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   可能我的问题比较“弱”,当然我自己也会继续努力学习这方面的知识,所需要的仅仅是高手们一个概貌式的介绍,以使我有一个感性的认知,先在此谢过了!

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[此贴子已经被作者于2008-11-30 21:45:07编辑过]
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 楼主| 发表于 2008-12-2 20:24:05 | 显示全部楼层

大家没有用到过这个软件来计算结构的吗?

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发表于 2010-3-31 15:07:22 | 显示全部楼层

我也想学,求助中

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发表于 2010-6-2 17:57:34 | 显示全部楼层

我只知道在XP和win7里面怎么用,毕设也正在做这个。首先进入dos系统,进入后找到你的CNS软件的位置,运行cns_solve_env.bat 然后进入你自己的文件包(这个里面有你自己的样品信息,如蛋白质的话就有序列(.seq)以及你从felix得到的NOE信息(两个:一个是NOE一个是二硫键)),第二步在cns的官网里面生成inp文件(如第一步从.seq文件生成的generate_seq.inp)用cns计算:

" s2 n6 m/ t: ^

输入 cns_solve < generate_seq.inp\就自动生成了一个.mtf。接下来你就回了 可以参考他们给的menu。

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发表于 2010-6-25 22:07:23 | 显示全部楼层
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